在全市2000余种野生动物资源中，有相当一部分属国家级保护动物。如属国家一级保护动物的遗鸥，为世界上濒临灭绝动物之一，也是人类认识最晚的鸟种之一。据专家考证，鄂尔多斯遗鸥种群为世界三大遗鸥繁殖种群之冠。目前已发现的数量约5000多只。还有国家二级保护动物白天鹅，数量也较多。还有经济价值较高的石貂、黄喉貂等。